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MLST分型

MLST分型

多位点序列分型(Multilocus Sequence Typing,MLST)是一种基于多个保守基因序列差异进行菌株分类的方法。该方法通过分析多个管家基因(Housekeeping genes)的序列变异,根据不同位点组合形成特定的序列型(Sequence Type,ST),从而实现菌株之间的遗传关系分析。

MLST具有检测标准化、结果重复性高以及数据库资源丰富等特点,已广泛应用于细菌群体结构分析、菌株溯源和流行关系研究。

1. 服务内容

类别

详情

分析项目

MLST序列分型分析

通过目标菌株多个管家基因序列分析,与标准MLST数据库进行比对,获得菌株对应的等位基因(Allele)类型及序列型(ST)

菌株DNA序列获取

管家基因序列分析

等位基因(Allele)鉴定

序列型(ST)判定

菌株遗传关系分析

2. 技术特点

  • 标准化程度高:基于国际通用管家基因组合及标准数据库,检测流程规范统一。

  • 结果重复性强:不同实验室间检测结果具有良好可比性,便于数据共享与追溯。

  • 数据库资源丰富:可与全球公共MLST数据库比对,快速获得菌株分型信息。

3. 技术流程

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4. 应用场景

  • 细菌群体结构分析:用于解析菌株群体的遗传多样性及群体结构特征。

  • 菌株溯源分析:辅助判断菌株来源及传播关系,支持流行病学调查。

  • 菌种资源管理:用于菌株保藏、筛选及资源库构建过程中的分型确认。

  • 科研研究:支持微生物进化关系、群体遗传学等相关研究。

5. 服务优势

优势

详细说明

标准化分型体系

基于国际通用MLST数据库和标准分析流程,保证结果可靠性和可重复性

数据共享便利

分型结果可与全球公共数据库比对,便于跨实验室数据交流与结果追溯

检测流程成熟

技术体系成熟稳定,适用于大规模菌株群体分析

方案按需定制

菌株分型项目的样本要求、检测周期及分析深度因菌株类型、目标基因数量及数据库匹配情况而异