cgMLST分析

cgMLST分析

核心基因组多位点序列分型（core genome Multilocus Sequence Typing，cgMLST）是在传统MLST基础上的扩展方法，通过分析更多核心基因位点，提高菌株之间遗传差异识别能力。相比传统MLST主要分析少量管家基因，cgMLST可基于数百至数千个核心基因进行比较，具有更高的分辨率，适用于近缘菌株区分及精细化菌株关系分析。

1. 服务内容

2. 技术特点

• 分辨率高：基于数百至数千个核心基因位点分析，可识别菌株间细微遗传差异。

• 区分能力强：适用于近缘菌株、暴发溯源等高精度分型需求。

• 结果可视化：以聚类树、最小生成树等形式直观展示菌株遗传关系。

最小生成树示例图片

3. 应用场景

• 近缘菌株精细区分：用于常规分型方法难以区分的近缘菌株鉴别。

• 暴发溯源分析：辅助识别疫情或污染事件中的菌株传播链。

• 菌株谱系分析：支持菌株谱系结构及进化关系研究。

• 科研与产业应用：服务于微生物基因组学、群体遗传学及相关产业质量控制需求。

4. 服务优势