宏基因组测序
宏基因组测序
宏基因组测序（Metagenomic Sequencing）直接对环境或复杂样本（如肠道内容物、土壤、发酵食品、水体等）中全部微生物的基因组DNA进行高通量测序，无需分离培养，可全面解析样本中微生物群落的物种组成、相对丰度及功能潜能，是研究复杂微生态系统的重要技术手段。
相较于依赖纯培养的传统鉴定方式，宏基因组测序能够覆盖样本中不可培养或难培养的微生物类群，更真实地反映群落原始结构。
1. 服务内容
服务环节 | 服务内容 |
项目咨询 | 根据样本类型及研究目标（物种组成解析/功能潜能分析）确定测序深度与分析策略 |
样本检测 | 环境/复杂样本总DNA提取、文库构建及测序 |
数据质控 | 去除低质量序列、接头污染及宿主/背景序列，获得高质量有效数据 |
物种组成分析 | 基于reads或组装序列的物种注释及丰度分析，多样性指数（Alpha/Beta）计算 |
功能注释分析 | 基因功能数据库（如KEGG、eggNOG等）比对，代谢通路富集分析 |
功能注释扩展 | 可拓展CAZy（碳水化合物酶）、CARD/ResFinder（抗性基因）、VFDB（毒力因子）分析，MGE分析 |
组装分箱（可选） | 可选择宏基因组组装（assembly）及基因组分箱（binning），获得高质量宏基因组组装基因组（MAG） |
报告交付 | 物种组成图谱、多样性分析结果、功能注释结果及原始数据 |
2. 技术特点
免培养：直接解析样本原始微生物群落结构，避免可培养菌种带来的偏差；
物种—功能双维度：同步获得群落物种组成与功能潜能信息；
分辨率高：结合组装分箱策略，部分场景下可实现种/株水平的物种解析。
3. 应用场景
发酵食品菌群结构解析（泡菜、酸奶、酱油、豆制品等）；
肠道及环境微生态研究；
益生菌产品菌群背景分析及批次一致性监控；
环境污染及生物修复相关微生物群落研究。
4. 示例结果展示
群落组成柱状图（示例）
5. 服务优势
优势 | 详细说明 |
群落解析全面 | 同时覆盖可培养与不可培养微生物，全面反映样本真实群落结构 |
物种功能联合分析 | 在获得物种组成的同时，提供代谢通路及功能基因层面的解读 |
分析流程成熟 | 标准化生物信息学分析流程，结果可重复性好，便于组间横向比较 |
应用场景广泛 | 适用于食品发酵、肠道健康、环境生态等多领域复杂样本分析需求 |
